Rólunk

2023. január 23. hétfő

A 2023.-ban létrehozott Bioinformatika Központi Egység (BKE) elsődleges feladata a kutatók támogatása új generációs szekvenálási (NGS) adatok elemzésével. Napjainkban, a bioinformatika elengedhetetlen egy genetikai tulajdonság vagy betegség megérétsében.

 

Ennek elérésére, meghatározzuk a sorrendjét (szekvenciáját) pár száz milliótól több milliárd a DNS vagy RNS elapegységnek. A genetikai kódunk nagyon hosszú és jelenlag csak reszeket tudunk folyamatosan meghatározni. Ezeket a leolvasásokat aztán egy ismert referencia sorrendhez vagy egymáshoz illesztjük, így rekonstruálve a genetikai kódot. Ezeknek a kísérleteknek a szépsége hogy hollisztikus képet kapunk, az eredmények megmutatják az összes eltérést(mutációt) minták között, az össze gént aminek megváltozott az aktivitása, minden helyet ahová egy transzkripciós faktor hozzá kötödött a DNShez és így tovább. Ez az aprioir megközelítés minimalizálja az emberi elfogultságot. At eredmények lehetnek kvalitatívak (mi a szokatlan a betegek genomjában, hova köt be adott transzkripciós faktor egy adott körülmény következtében) és kvantitatívak (Mennyire eltérően expresszálnak a  gének, mennyire szaporodott fel egy kórokozó)

 

A BKE kezeli és tárolja a KOKI NGS kísérleteinek nyers adatainak a kollekcióját.

 

<< Vissza